上海辰山植物園原系松江區(qū)辰山村(cūn)的(de)村(cūn)莊、農田、魚塘、河(hé)道，企業廠房(fáng)以及林(lín)場(chǎng)。園區(qū)内的(de)辰山是松江大(dà)小九座山中的(de)一座，系浙江天目山的(de)餘脈，東西長(cháng)700米，南(nán)北(běi)寬約300米，海拔71.4米，辰山山體約爲16公頃。園區(qū)其它主要爲寬整的(de)平地，地面平均高(gāo)程爲3.0米，平地面積約172公頃，河(hé)道及溪流面積約爲18公頃。

　　2004年年初，爲了(le)進一步加強上海現代化(huà)國際大(dà)都市綜合競争力，改善城(chéng)市生态環境質量，縮短與世界級城(chéng)市的(de)差距，營造人(rén)與自然和(hé)諧的(de)生态環境，上海市委、市政府決策建設上海辰山植物園這(zhè)一重大(dà)公益性生态項目。2004年4月(yuè)7日，韓正市長(cháng)赴松江區(qū)工作調研，原則同意在辰山建設上海辰山國家植物(wù)園。随即，上海市綠化(huà)局與松江區(qū)人(rén)民政府聯合成立上海辰山國家植物(wù)園前期籌備工作小組，負責前期籌備工作。2004年12月(yuè)22日，韓正市長(cháng)召開市府專題會議(yì)，聽(tīng)取了(le)市綠化(huà)局和(hé)松江區(qū)人(rén)民政府關于辰山植物(wù)園的(de)總體規劃彙報，同意了(le)該項目的(de)實施，并列入《上海市國民經濟和(hé)社會發展第十一個(gè)五年規劃綱要》。2004年12月(yuè)24日，上海市綠化(huà)管理(lǐ)局向上海市發展和(hé)改革委員(yuán)會報送《上海辰山國家植物(wù)園項目建議(yì)書(shū)》，市發改委以滬發城(chéng)[2004]第467号文批複同意立項。2005年8月(yuè)29日，上海市政府與中國科學院簽訂了(le)《合作共建上海辰山植物園工作協議(yì)書(shū)》。2005年8月(yuè)22日發布了(le)《上海辰山植物園方案設計招标文件》，遴選出德國瓦倫丁設計組合方案作進一步深化(huà)設計。2006年1月(yuè)26日，經上海市機構編制委員(yuán)會研究決定，同意建立事業單位上海辰山植物園（籌），人(rén)員(yuán)編制初步核定爲50名。2006年2月(yuè)14日，市綠化(huà)局向市政府專題彙報辰山植物(wù)園方案，市政府原則同意由德國瓦倫丁規劃設計組合和(hé)上海市園林(lín)設計院組成設計聯合體，進行方案深化(huà)設計。2007年1月(yuè)10日，上海市綠化(huà)管理(lǐ)局成立上海辰山植物園工程建設指揮部，夏穎彪、方岩分(fēn)别擔任項目總指揮和(hé)常務副指揮，胡永紅任項目總工程師，全面負責工程建設。按照(zhào)一次規劃，分(fēn)期、分(fēn)塊實施的(de)要求，項目共分(fēn)爲一期、西南(nán)塊、東南(nán)塊、東北(běi)塊四塊。2007年3月(yuè)15日，上海市建設和(hé)交通(tōng)委員(yuán)會以滬建交[2007]165号發文同意上海辰山植物園一期工程（技術部分(fēn)）的(de)初步設計。2007年3月(yuè)31日上海辰山植物園正式開工。2007年6月(yuè)14日，在市綠化(huà)管理(lǐ)局召開了(le)《上海辰山植物園總體方案》評審會，與會專家一緻贊同該總體方案通(tōng)過評審，上海市規劃局以滬規景[2007]686号文批複同意。