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上海市資源植物(wù)功能基因組學實驗室
中國上海市松江區(qū)辰花路3888号
上海辰山植物(wù)科學研究中心
郵編 201632
電話(huà)(021)37792288
傳真(021)67657811
實驗平台

一、 遺傳轉化(huà)平台  

該平台主要開展遺傳轉化(huà)、基因編輯、細胞融合、倍性育種、器官培養、共生培養、脫毒快(kuài)繁、次生代謝調控及珍稀瀕危植物(wù)拯救等研究工作。平台實驗室建制較爲齊全,培養間平面200 m2,儲備100多(duō)種植物(wù)離體再生技術體系,例如普陀鵝耳枥、蛇足石杉、紅豆杉、花葉熊掌木(mù)、芍藥屬等物(wù)種。   

負責人(rén):朱木(mù)蘭 研究員(yuán)

二、 代謝分(fēn)析平台

爲植物(wù)小分(fēn)子代謝産物(wù)的(de)分(fēn)析工作提供所需的(de)實驗設備設施。

負責人(rén): 孔羽  高(gāo)級工程師

主要儀器介紹如下(xià):

(一) 超高(gāo)效液相色譜-高(gāo)分(fēn)辨質譜聯用(yòng)儀

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生産廠家及型号:

美(měi)國 Thermo Fisher Scientific 公司,Q-Exactive plus

功能應用(yòng)介紹:

Q-Exactive plus LC-MS/MS系統将四極杆母離子選擇性與高(gāo)分(fēn)辨率和(hé)準确質量數Orbitrap檢測相結合,主要用(yòng)于非目标或目标化(huà)合物(wù)篩查,也(yě)能夠實現廣泛的(de)定性和(hé)定量應用(yòng),特别适合于複雜(zá)背景下(xià)的(de)目标成分(fēn)分(fēn)離、結構鑒定,可(kě)以快(kuài)速可(kě)靠地識别、定量和(hé)确認更多(duō)化(huà)合物(wù)。

HRAM和(hé)全掃描能力可(kě)以自始至終捕獲所有樣品數據,從而實現回顧性數據分(fēn)析而無需再次掃描樣品,可(kě)完成大(dà)規模代謝組學樣品分(fēn)析;分(fēn)辨率高(gāo)達140,000 FWHM,可(kě)消除同量異序同分(fēn)異構化(huà)合物(wù)的(de)幹擾;全離子碎片(AIF)模式和(hé)多(duō)重解離技術——源内CID和(hé)HCD可(kě)以輔助化(huà)合物(wù)識别;四個(gè)數量級的(de)掃描動态範圍可(kě)以在一次掃描中同時(shí)檢測痕量級和(hé)高(gāo)豐度化(huà)合物(wù)。其典型應用(yòng)包括:(1)藥物(wù)代謝物(wù)鑒定,尤其是複雜(zá)體系中痕量成分(fēn)的(de)鑒定和(hé)分(fēn)析;(2)天然産物(wù)組分(fēn)分(fēn)析、中藥現代化(huà)、藥物(wù)研發等;(3)藥物(wù)殘留或環境污染物(wù)的(de)鑒定、确認和(hé)真假藥鑒别等。

用(yòng)戶可(kě)進行有機小分(fēn)子的(de)結構鑒定分(fēn)析,藥物(wù)代謝物(wù)及其衍生物(wù)定性分(fēn)析、植物(wù)活性成分(fēn)等的(de)結構鑒定分(fēn)析等。

主要配置:

該儀器的(de)質量範圍(m/z)爲 50~2000,離子源:ESI源;質量分(fēn)析器:采用(yòng)四極杆與靜電場(chǎng)軌道阱串聯的(de)組合;液相系統:戴安U3000超高(gāo)壓液相色譜(配DAD紫外檢測器);二級質譜碎裂方式(MS/MS):HCD;數據系統(Software):Xcalibur數據采集系統、MassFrontier結構解析軟件,Compound Discoverer 2.1代謝組學軟件、TRACEFINDER定量軟件。

管理(lǐ)規則:

1、樣品以課題組委托的(de)方式交給儀器管理(lǐ)員(yuán)進行針對(duì)性的(de)檢測和(hé)條件優化(huà),不得(de)自行上機操作儀器。

2、需自行根據自己樣品的(de)特性進行樣品前處理(lǐ),然後在網上提交預約,預約時(shí)請明(míng)确檢測的(de)目标物(wù),方便我們根據情況聯合處理(lǐ)。切記:樣品不可(kě)含有DMSO、甘油等表面活性劑,不可(kě)含有非揮發性的(de)酸、堿及其鹽等(僅氨水(shuǐ)、甲酸、乙酸可(kě)用(yòng)),樣品上機前需有機濾膜0.22 um過濾。

3、原則上每周一,周二進行儀器的(de)校正等維護,然後進行小分(fēn)子樣品分(fēn)子量及LC-MS的(de)檢測。

4、樣品由孔羽根據樣品檢測類型及樣品情況安排機時(shí)進行檢測。不以網上預約機時(shí)爲準。

5、若因樣品問題導緻的(de)色譜柱或儀器堵塞,研究組需承擔相應的(de)賠償責任。

按時(shí)計費:

開機費200.00 元;測樣按小時(shí)收費

儀器管理(lǐ)員(yuán):孔羽 (電話(huà): 37792288-929)

(二) 超高(gāo)效液相色譜-三重四級杆質譜聯用(yòng)儀

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生産廠家及型号:

美(měi)國 AB Sciex 公司,Qtrap 6500+

功能應用(yòng)介紹:

該系統主要應用(yòng)于藥物(wù)代謝及藥物(wù)動力學研究以及小分(fēn)子代謝産物(wù)的(de)定量分(fēn)析。1)産生更多(duō)離子,聚焦和(hé)傳輸更多(duō)離子,聚焦和(hé)傳輸更多(duō)離子,2)速度更快(kuài)的(de) MRM3 增強的(de)選擇性,3):借助SCIEX 質譜平台,QTRAP 技術具有高(gāo)出基本三重四極杆質譜儀100倍的(de)全掃描靈敏度,在增強定性分(fēn)析工作流程的(de)同時(shí),發揮同步定量分(fēn)析和(hé)圖譜庫搜索工作流程的(de)優勢。該靶向功能分(fēn)析定量篩選質譜系統具體配置包括毛細管電泳及高(gāo)靈敏度的(de)串聯四極杆質譜儀(Qtrap 6500),在靶化(huà)合物(wù)定量篩選中具有廣泛的(de)應用(yòng)。可(kě)用(yòng)于目标化(huà)合物(wù)的(de)定量篩選研究等等。

QTRAP 6500+系統在分(fēn)離度方面有較佳的(de)優勢。QTRAP三級質譜掃描功能(MS/MS/MS)可(kě)提供更明(míng)确的(de)質量選擇。SCIEX QTRAP系統的(de)掃描功能,包括全量程掃描(Full Scan)、選擇離子掃描(SIM)、選擇反應串聯質譜掃描(SRM)、子離子掃描(Product Ion Scan)、母離子 掃描(Precursor Ion Scan)、中性丢失掃描(Neutral Loss Scan)、多(duō)反應監測掃描(MRM)、混合掃描(Mixed Scan Mode)、正/負離子快(kuài)速切換掃描、自動MS、MS/MS切換掃描(IDA)、增強型全掃描(EMS)、增強型多(duō)電荷離子掃描(EMC)、增強型子離子掃描(EPI)、增強型高(gāo)分(fēn)辨掃描(ER)、時(shí)間延遲碎裂掃描(TDF)、MS3掃描、MRM3掃描。該系統和(hé)技術不僅僅爲生物(wù)分(fēn)析而設計,也(yě)适用(yòng)于複雜(zá)的(de)食物(wù)殘留分(fēn)析、環境分(fēn)析、脂質分(fēn)析和(hé)法醫藥物(wù)篩查等應用(yòng)。

主要技術參數:

1、 質量範圍(m/z):50-1700 m/z;

2、 質量準确度:<2 ppm;

3、 質量穩定性:±0.1 amu/24h。

主要配置:

1、離子源:電噴霧離子源(ESI)、大(dà)氣壓化(huà)學電離源(APCI);

2、質量分(fēn)析器:三重四極杆與線性離子阱複合型質譜(QTRAP)的(de)組合(Q1四極杆,Q2四極杆,Q3線性離子阱);

3、超高(gāo)液相系統(UPLC):超高(gāo)壓液相色譜(二元梯度混合泵、自動進樣器、柱溫箱);

4、數據系統(Software):Analyst數據采集系統、OS軟件。

管理(lǐ)規則:

該質譜儀爲三重四級杆質譜儀,主要用(yòng)于靶向化(huà)合物(wù)檢測,需要通(tōng)過标準品采集質譜檢測信息。1.在預約前請告知所要檢測的(de)代謝物(wù)種類信息以确定是否有現成的(de)方法進行檢測;若無現成方法,需自備标準品進行方法開發。2.絕對(duì)定量檢測需自備标準品配置标準曲線樣品。3.若因樣品問題導緻的(de)色譜柱或儀器堵塞或嚴重污染(樣品不可(kě)含有DMSO、等表面活性劑,不可(kě)含有非揮發性的(de)酸、堿及其鹽等),研究組需承擔相應的(de)賠償責任。

按時(shí)計費:

開機費200.00 元;測樣按小時(shí)收費

儀器管理(lǐ)員(yuán):孔羽 (電話(huà):37792288-929)

(三) 氣相色譜-四級杆飛(fēi)行時(shí)間質譜聯用(yòng)儀

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生産廠家及型号:

美(měi)國 Agilent 公司,7200B

功能應用(yòng)介紹:

該質譜儀爲四級杆串聯飛(fēi)行時(shí)間高(gāo)分(fēn)辨質譜儀,主要用(yòng)于代謝物(wù)與微量成分(fēn)的(de)定性定量分(fēn)析、代謝組學、脂質組學研究。

主要技術參數:

1、 質量範圍(m/z):50-1700 m/z;

2、 質量精度<2 ppm;

3、 掃描速度1-50譜圖/秒;

4、 分(fēn)辨率:>12000FWHM 1pg OFN(八氟奈)不分(fēn)流進樣,在m/z 271.9867;

5、 動态線性範圍可(kě)高(gāo)達5個(gè)數量級;

6、 二級高(gāo)分(fēn)辨質譜,可(kě)以提供更豐富的(de)化(huà)合物(wù)結構信息。

主要配置:

1、離子源:配置EI源和(hé)CI源;

2、質量分(fēn)析器:石英鍍金雙曲面四極杆串聯時(shí)間飛(fēi)行管;

3、氣相系統(GC):配150位液體自動進樣器;

4、數據系統(Software):Masshunter Workstation數據采集處理(lǐ)系統、Mass Profinder Professional軟件、NIST 14譜庫。

管理(lǐ)規則:

1.在預約前請告知所要檢測的(de)代謝物(wù)種類信息;2.絕對(duì)定量檢測需自備标準品配置标準曲線樣品。3.若因樣品問題導緻的(de)色譜柱損傷或儀器嚴重污染或(樣品溶液不可(kě)含有水(shuǐ)、酸堿等已損傷色譜柱的(de)強極性試劑),如造成色譜柱損傷研究組需承擔相應的(de)賠償責任。

按時(shí)計費:

開機費300.00 元;測樣按小時(shí)收費

儀器管理(lǐ)員(yuán):孔羽 (電話(huà):37792288-929)

(四) 液相色譜-三重四級杆質譜聯用(yòng)儀

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生産廠家及型号:

美(měi)國 Agilent 公司,6460

功能應用(yòng)介紹:

該質譜儀爲三重四級杆低分(fēn)辨質譜儀,主要用(yòng)于代謝物(wù)與微量成分(fēn)的(de)定性定量分(fēn)析、代謝組學、脂質組學雜(zá)質分(fēn)析等多(duō)種領域研究。

其經惰性處理(lǐ)的(de)鍍白金離子傳輸毛細管,消除電荷蓄積作用(yòng),同時(shí)保證在極性切換過程中不損失離子;高(gāo)頻(pín)、小口徑八極杆,更有效地聚焦離子成束,有助于MRM的(de)高(gāo)靈敏的(de)采集;線性加速的(de)高(gāo)能碰撞六極杆反應池,有效消除背景噪音(yīn)和(hé)“記憶效應”,從而保證了(le)痕量樣品快(kuài)速、準确的(de)分(fēn)析結果。其配有調諧溶液自動輸送系統,軟件控制的(de)自動調諧,相對(duì)操作簡便,培訓後可(kě)自行操作。

其具備定量分(fēn)析參數自動優化(huà)功能--每個(gè)提交的(de)化(huà)合物(wù),針對(duì)選定的(de)子離子自動進行傳輸電壓和(hé)碰撞能量的(de)優化(huà);MRM動态數據采集功能--MRM數據的(de)采集,随色譜峰的(de)洗脫,動态變更,将每個(gè)采樣周期中監測的(de)化(huà)合物(wù)的(de)數目降到最低,進而保證每個(gè)化(huà)合物(wù)在出峰時(shí),都可(kě)以獲得(de)足夠的(de)采樣時(shí)間;定量分(fēn)析方法開發功能--引導用(yòng)戶準确、簡便、快(kuài)速、高(gāo)效地建立定量分(fēn)析方法,可(kě)直接導入采集方法中的(de)有關設置(如:母離子?子離子對(duì)),并可(kě)在數據計算(suàn)前,對(duì)定量方法進行必要的(de)驗證,避免操作過程中的(de)疏漏;校正曲線拟合助手--提供多(duō)種拟合線型,權重因子,并直接計算(suàn)各種線型,在不同權重因子下(xià)的(de)校正方程及其相關系數,用(yòng)戶隻需根據需要選擇,軟件即可(kě)直接采用(yòng)所選方程計算(suàn)樣品數據;多(duō)種數據輸出格式--便于用(yòng)戶使用(yòng)其它軟件,進行更專門的(de)數據計算(suàn)或比對(duì);直觀靈活、功能全面的(de)數據浏覽-- 多(duō)成分(fēn)數據同時(shí)浏覽;不用(yòng)顔色标記數據是否滿足實驗要求;離子比例計算(suàn),有助于限量檢查的(de)确證判斷。

主要技術參數:

1、 質量範圍(m/z):20-3000 m/z;

2、 飛(fēi)克(femtogram)級的(de)檢測限;線性範圍達到106;

主要配置:

1、離子源:ESI、APCI源;

2、質量分(fēn)析器:三重四極杆;

3、液相系統(HPLC):Agilent 1260HPLC,配有G4212B DAD紫外檢測器、G1316A柱溫箱、G1367E高(gāo)效能自動進樣器、G1322A在線脫氣機G1312B二元梯度混合泵。

4、數據系統(Software):Masshunter Workstation數據采集處理(lǐ)系統。

5、氮氣發生器、高(gāo)純氮等。

管理(lǐ)規則:

1.培訓後可(kě)自行操作(詳細電子教程保存于控制電腦(nǎo)内);2.檢測需自備标準品、流動相、色譜柱等耗材。3.若因樣品問題導緻儀器嚴重污染或損傷(樣品不可(kě)含有DMSO、等表面活性劑,不可(kě)含有非揮發性的(de)酸、堿及其鹽等),研究組需承擔相應的(de)賠償責任。

按時(shí)計費:

開機費200.00 元;測樣按小時(shí)收取機時(shí)費

儀器管理(lǐ)員(yuán):孔羽 (電話(huà):37792288-929) 

(五) 氣質聯用(yòng)儀(單四級杆)

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生産廠家及型号:

美(měi)國 Agilent 公司,7890A-5975C

功能應用(yòng)介紹:

該質譜儀爲單四級杆低分(fēn)辨質譜儀,主要用(yòng)于可(kě)以進行揮發性有機物(wù)的(de)定性與定量分(fēn)析:色譜峰譜庫檢索(NIST 08譜庫)、百分(fēn)比報告、内/外标法定量測定。離子源溫可(kě)達300℃, 适合揮發有機物(wù)質(沸點<300℃)的(de)定性、定量分(fēn)析;惰性氦氣爲載氣提高(gāo)分(fēn)析速度;培訓後可(kě)自行操作。

主要技術參數:

1、 質量掃描範圍:1-1050 u;

2、 掃描速率:12500 u/s;

3、 靈敏度:進樣1uL濃度爲20pg/uL的(de)八氟萘标樣,m/z272離子信噪比爲10:1

主要配置:

1、 氣相色譜:帶FID檢測器;

2、 自動進樣器:150位液體進樣器;

3、質量分(fēn)析器:四級杆質譜檢測器;

4、數據系統(Software):Chemstation數據采集處理(lǐ)系統、NIST 08譜庫。

管理(lǐ)規則:

1.培訓後可(kě)自行操作(詳細電子教程保存于控制電腦(nǎo)内);2.檢測需自備标準品、特殊色譜柱等耗材。3.若因樣品問題導緻的(de)色譜柱損傷或儀器嚴重污染,研究組需承擔相應的(de)賠償責任。

按時(shí)計費:

開機費200.00 元(使用(yòng)高(gāo)純氮);測樣按小時(shí)收取機時(shí)費

儀器管理(lǐ)員(yuán):孔羽 (電話(huà):37792288-929) 

(六) 超高(gāo)效液相色譜儀

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(此圖源于網絡,具體以實物(wù)爲準)

生産廠家及型号:

美(měi)國 Agilent 公司,1260 Infinity II

功能應用(yòng)介紹:

該儀器爲超高(gāo)效液相色譜儀類,主要用(yòng)于①分(fēn)離分(fēn)析代謝物(wù)的(de)組分(fēn)含量。②藥物(wù)質量控制。③分(fēn)析藥物(wù)在體内的(de)殘量。④測定代謝産物(wù)。

主要技術參數:

1、 最高(gāo)耐壓:不低于78MPa(780Bar);

2、 飛(fēi)克(femtogram)級的(de)檢測限;線性範圍達到106;

主要配置:

1、四元梯度泵:含主動密封墊清洗蠕動泵,實時(shí)維護泵的(de)使用(yòng)性能;

2、在線真空脫氣機:含集成脫氣單元,4個(gè)脫氣通(tōng)道;

3、自動進樣器:120個(gè)樣品瓶(2mL),進樣量範圍0.1-100 μL。

4、智能化(huà)柱溫箱:柱溫箱可(kě)以左右同時(shí)控制不同溫度;内配置6通(tōng)閥,耐壓不低于78Mpa(780Bar),可(kě)進行雙柱切換等高(gāo)級功能。

5、二極管陣列檢測器DAD

6、數據系統(Software):Masshunter Workstation數據采集處理(lǐ)系統。

管理(lǐ)規則:

1.培訓後可(kě)自行操作(詳細電子教程保存于控制電腦(nǎo)内);2.檢測需自備标準品、流動相等耗材。3.若因樣品問題導緻的(de)色譜柱損傷(自備除外)或儀器嚴重污染,研究組需承擔相應的(de)賠償責任。

按時(shí)計費:

開機費50.00 元;測樣按小時(shí)收取機時(shí)費

儀器管理(lǐ)員(yuán):孔羽 (電話(huà):37792288-929) 

 

相關儀器應用(yòng)案例舉例

附表1、液相色譜及液相色譜質譜聯用(yòng)的(de)應用(yòng)案例


應用(yòng)領域

具體應用(yòng)對(duì)象舉例

1

生物(wù)

蛋白質、肽類、核酸、氨基酸、植物(wù)代謝物(wù)等

2

食品

食品營養成分(fēn)、添加劑、污染物(wù)等分(fēn)析

3

醫藥

抗生素、磺胺類藥物(wù);中藥鑒别,生物(wù)堿、黃(huáng)酮。。。。

4

環境

多(duō)環芳烴、多(duō)氯聯苯、小基化(huà)合物(wù)、酚類、鄰苯二甲酸酯等;農殘、除草(cǎo)劑等

5

化(huà)工

表面活性劑、化(huà)妝品、染料等等

6

法醫學

血、尿、唾液等特定成分(fēn)的(de)檢測

附表2、氣相色譜及氣相色譜質譜聯用(yòng)的(de)應用(yòng)案例


應用(yòng)領域

具體應用(yòng)對(duì)象舉例

1

生物(wù)

植物(wù)中的(de)萜類、胺類、脂肪酸及酯類

2

食品

香料、牛奶、黃(huáng)油等的(de)不飽和(hé)脂肪酸、香氣成分(fēn)

3

醫藥

中藥揮發油

4

環境

水(shuǐ)中的(de)芳香烴、殺蟲劑、除草(cǎo)劑等農藥

空氣中的(de)有機污染物(wù),如苯類、苯酚、鹵代烴等

5

化(huà)工

發動機燃料中的(de)烴類

6

石油

汽油中的(de)各種烷烴、原油成分(fēn)等

7

法醫學

血液中的(de)酒精、尿液中的(de)可(kě)卡因、毒鼠強等

三、 分(fēn)子生物(wù)學研究相關

主要儀器介紹如下(xià):

(一) 化(huà)學發光(guāng)成像儀

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生産廠家及型号:

DU-934P-BV (CCD英國andor,其他(tā)爲國産)

功能應用(yòng)介紹:

滿足植物(wù)學研究的(de)需要,解決植物(wù)活體熒光(guāng)成像時(shí)葉綠體熒光(guāng)幹擾的(de)問題,針對(duì)不同的(de)實驗需求配置突變體篩選暗箱或光(guāng)周期暗箱。實驗無需将植物(wù)樣本做(zuò)任何處理(lǐ),并可(kě)通(tōng)過生物(wù)發光(guāng)(LUC)和(hé)熒光(guāng)方法實時(shí)觀察植物(wù)樣本基因表達的(de)變化(huà),準确定量分(fēn)析。

主要技術參數:

1、 CCD:像素:≥ 1024 x 1024 ,像素點≥13 x 13-μm,量子效率:≥ 95%@575nm ,滿阱電荷:100,000,制冷(lěng):-80°C (ambient air at 20°C)

2、 鏡頭: 50mm焦距,F1.8高(gāo)通(tōng)光(guāng)量定焦廣角鏡頭

3、 鋁合金暗箱46*42*72cm (數控加工,氧化(huà)發黑(hēi)處理(lǐ));相機固定座(數控加工,氧化(huà)發黑(hēi)處理(lǐ));6位濾鏡輪(數控加工,氧化(huà)發黑(hēi)處理(lǐ));

4、  手動升降台(數控加工,氧化(huà)發黑(hēi)處理(lǐ));

5、 光(guāng)源:2* LED白色輔助光(guāng)源;2* LED蘭色輔助光(guāng)源 ;2* LED紅色輔助光(guāng)源。

主要配置:

1、CCD;

2、C型接口;

3、鏡頭;

4、暗箱。

管理(lǐ)規則:

1、檢測需自備耗材。2、若因人(rén)爲導緻儀器損傷,研究組需承擔相應的(de)賠償責任。

按時(shí)計費:

開機費50 元;測樣按小時(shí)收取機時(shí)費

儀器管理(lǐ)員(yuán):邵文 (37792288-930) 

(二) 實時(shí)定量遺傳分(fēn)析儀

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生産廠家及型号:

Pyro Mark Q48

功能應用(yòng)介紹:

該儀器測序原理(lǐ)爲:焦磷酸測序。具備SNP分(fēn)析、突變及插入缺失檢測分(fēn)析、CpG/CpN甲基化(huà)定量分(fēn)析、微生物(wù)鑒定分(fēn)型等功能;适用(yòng)于基因頻(pín)率定量分(fēn)析,細菌、病毒、真菌的(de)快(kuài)速分(fēn)型和(hé)鑒定;在一個(gè)反應中對(duì)一段片段中所有甲基化(huà)位點進行逐點的(de)精确定量分(fēn)析;适用(yòng)于植物(wù)甲基化(huà)定量測序,無需專業生物(wù)信息人(rén)員(yuán)判讀,無需額外的(de)數據分(fēn)析軟件;對(duì)1-48個(gè)樣本的(de)分(fēn)析一鍵完成,5分(fēn)鐘(zhōng)完成所有樣本分(fēn)析。

主要技術參數:

1、 樣品通(tōng)量: 48個(gè)樣本;

2、 定量測序,定量線性範圍:5%-95%;

3、 結果可(kě)靠性:測序第1個(gè)堿基開始即爲可(kě)信結果;

4、 連續堿基準确性:可(kě)精确讀取8個(gè)的(de)連續單個(gè)重複堿基;

5、 實時(shí)監測:可(kě)以實時(shí)體現并且監測反應過程;

6、 内在的(de)質控标準:檢測甲基化(huà)位點的(de)同時(shí)即可(kě)監測樣品的(de)亞硫酸氫鹽轉化(huà)程度,無需額外質控;

7、 無需建庫,直接測序;

8、 甲基化(huà)位點精确定量分(fēn)析無需構建克隆。

主要配置:

1、主機;

2、軟件包:Pyromark Q48 Autoprep、PyroMark Assay Design 2.0;

管理(lǐ)規則:

1、檢測需自備耗材。2、若因人(rén)爲導緻儀器損傷,研究組需承擔相應的(de)賠償責任。

按時(shí)計費:

開機費0 元;測樣按小時(shí)收取機時(shí)費

儀器管理(lǐ)員(yuán):暫無 

(三) 納米孔(核酸)測序儀

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生産廠家及型号:

英國Oxford Nanopore GridION X5 

功能應用(yòng)介紹:

該儀器測序原理(lǐ)是:通(tōng)過靈活的(de)文庫準備方案控制DNA/RNA的(de)讀長(cháng)。測序儀通(tōng)過頂端的(de)酶馬達控制DNA或RNA鏈的(de)移動并依次通(tōng)過納米孔,産生電流的(de)波動,儀器采用(yòng)專用(yòng)集成電路捕獲來(lái)自納米孔的(de)這(zhè)種電流波動信号,通(tōng)過算(suàn)法将其轉化(huà)成相應的(de)堿基響應數據并記錄下(xià)來(lái);納米孔底層的(de)電阻膜保證電流必須通(tōng)過納米孔,确保信号不受幹擾;基因通(tōng)過後,馬達蛋白分(fēn)離,納米孔準備好接受下(xià)一個(gè)片段。采用(yòng)納米孔測序技術對(duì)基因組進行實時(shí)長(cháng)讀長(cháng)測序,以幫助從頭組裝完整的(de)基因組、解決結構變異問題并評估其影(yǐng)響以及快(kuài)速鑒定混合種群的(de)種屬。該儀器能夠單次同時(shí)運行多(duō)個(gè)測序芯片,且不需要多(duō)個(gè)電腦(nǎo)進行數據處理(lǐ);能夠根據需要開始和(hé)停止運行單個(gè)測序芯片;需建庫、流程相對(duì)簡易;能夠進行實時(shí)數據分(fēn)析;具有長(cháng)讀長(cháng)的(de)測序能力;可(kě)用(yòng)于高(gāo)保真DNA和(hé)直接RNA測序。

主要技術參數:

1、可(kě)同時(shí)測序5個(gè)芯片,每個(gè)單獨測序的(de)芯片可(kě)達512個(gè)活動通(tōng)道;

2、每次實驗中,每個(gè)樣本可(kě)進行獨立的(de)檢測;可(kě)以對(duì)目标分(fēn)子進行實時(shí)選擇性測序,同時(shí)排斥無關聯的(de)分(fēn)子。

3、可(kě)以在實驗開始後很快(kuài)開始生成數據流,2分(fēn)鐘(zhōng)内産生可(kě)用(yòng)數據,以快(kuài)速獲得(de)結果;可(kě)以在實驗開始後很快(kuài)進行分(fēn)析,在獲得(de)結果後可(kě)以停止該實驗并開始下(xià)一個(gè)實驗。

4、樣本輸入量:介于10 pg 到 1 µg之間。

5、準确性: 30X一緻性準确度不低于99.8%。

6、質控标準:所有新的(de)測序芯片開始使用(yòng)前可(kě)以進行自動質量檢測,顯示可(kě)用(yòng)的(de)納米孔數目

主要配置:

1、主機;

2、軟件包;

管理(lǐ)規則:

1、檢測需自備耗材。2、若因人(rén)爲導緻儀器損傷,研究組需承擔相應的(de)賠償責任。

按時(shí)計費:

開機費0 元;測樣按小時(shí)收取機時(shí)費

儀器管理(lǐ)員(yuán):楊俊、王紅霞(受平台委托暫時(shí)代管) 

(四) 數字式PCR儀

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生産廠家及型号:

英國Oxford Nanopore GridION X5 

功能應用(yòng)介紹:

該儀器測序原理(lǐ)是:通(tōng)過靈活的(de)文庫準備方案控制DNA/RNA的(de)讀長(cháng)。測序儀通(tōng)過頂端的(de)酶馬達控制DNA或RNA鏈的(de)移動并依次通(tōng)過納米孔,産生電流的(de)波動,儀器采用(yòng)專用(yòng)集成電路捕獲來(lái)自納米孔的(de)這(zhè)種電流波動信号,通(tōng)過算(suàn)法将其轉化(huà)成相應的(de)堿基響應數據并記錄下(xià)來(lái);納米孔底層的(de)電阻膜保證電流必須通(tōng)過納米孔,确保信号不受幹擾;基因通(tōng)過後,馬達蛋白分(fēn)離,納米孔準備好接受下(xià)一個(gè)片段。采用(yòng)納米孔測序技術對(duì)基因組進行實時(shí)長(cháng)讀長(cháng)測序,以幫助從頭組裝完整的(de)基因組、解決結構變異問題并評估其影(yǐng)響以及快(kuài)速鑒定混合種群的(de)種屬。該儀器能夠單次同時(shí)運行多(duō)個(gè)測序芯片,且不需要多(duō)個(gè)電腦(nǎo)進行數據處理(lǐ);能夠根據需要開始和(hé)停止運行單個(gè)測序芯片;需建庫、流程相對(duì)簡易;能夠進行實時(shí)數據分(fēn)析;具有長(cháng)讀長(cháng)的(de)測序能力;可(kě)用(yòng)于高(gāo)保真DNA和(hé)直接RNA測序。

主要技術參數:

1、可(kě)同時(shí)測序5個(gè)芯片,每個(gè)單獨測序的(de)芯片可(kě)達512個(gè)活動通(tōng)道;

2、每次實驗中,每個(gè)樣本可(kě)進行獨立的(de)檢測;可(kě)以對(duì)目标分(fēn)子進行實時(shí)選擇性測序,同時(shí)排斥無關聯的(de)分(fēn)子。

3、可(kě)以在實驗開始後很快(kuài)開始生成數據流,2分(fēn)鐘(zhōng)内産生可(kě)用(yòng)數據,以快(kuài)速獲得(de)結果;可(kě)以在實驗開始後很快(kuài)進行分(fēn)析,在獲得(de)結果後可(kě)以停止該實驗并開始下(xià)一個(gè)實驗。

4、樣本輸入量:介于10 pg 到 1 µg之間。

5、準确性: 30X一緻性準确度不低于99.8%。

6、質控标準:所有新的(de)測序芯片開始使用(yòng)前可(kě)以進行自動質量檢測,顯示可(kě)用(yòng)的(de)納米孔數目

主要配置:

1、主機;

2、軟件包;

管理(lǐ)規則:

1、檢測需自備耗材。2、若因人(rén)爲導緻儀器損傷,研究組需承擔相應的(de)賠償責任。

按時(shí)計費:

開機費0 元;測樣按小時(shí)收取機時(shí)費

儀器管理(lǐ)員(yuán):暫無指定管理(lǐ)員(yuán) 

(五) 流式細胞儀

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生産廠家及型号:

PARTEC CyFlow 

功能應用(yòng)介紹:

該儀器配置488和(hé)365熒光(guāng)光(guāng)源。顆粒粒徑檢測範圍0.05-200um熒光(guāng)靈敏度 <50MESF FITC,<30MESF PE熒光(guāng)最佳分(fēn)辨率CV≤1%,最大(dà)速度:200,000細胞/秒絕對(duì)計數誤差≤2%,穩定性≥99.5%,分(fēn)辨率≤1%。用(yòng)于根據預選的(de)參量範圍對(duì)指定的(de)細胞亞群進行分(fēn)析,換算(suàn)植物(wù)細胞c值(DNA總量)和(hé)倍性測量。

管理(lǐ)規則:

1、檢測需自備耗材。2、若因人(rén)爲導緻儀器損傷,研究組需承擔相應的(de)賠償責任。

按時(shí)計費:

開機費0 元;測樣按小時(shí)收取機時(shí)費

儀器管理(lǐ)員(yuán):邵文(37792288-930) 

(六) 實時(shí)熒光(guāng)定量PCR

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生産廠家及型号:

ABI step one plus 

功能應用(yòng)介紹:

可(kě)選耗材:96孔反應闆與光(guāng)學蓋膜/96孔反應闆與光(guāng)學平蓋/0.1mL 8連管與光(guāng)學平蓋,支持容量:10-30 μL,4通(tōng)道96孔、4℃-100℃溫度範圍,安裝時(shí)已校準染料:SYBR® Green I、FAM™、VIC®、JOE™、NED、TAMRA、ROX™ 染料,被動參照(zhào)染料:ROX™染料。用(yòng)于基因相對(duì)定量分(fēn)析的(de)基因表達分(fēn)析,以标準曲線爲基礎進行絕對(duì)定量分(fēn)析,定性的(de)PCR擴增後核酸序列。

管理(lǐ)規則:

1、檢測需自備耗材。2、若因人(rén)爲導緻儀器損傷,研究組需承擔相應的(de)賠償責任。

按時(shí)計費:

開機費0 元;測樣按小時(shí)收取機時(shí)費

儀器管理(lǐ)員(yuán):邵文(37792288-930) 

(七) 酶标儀

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生産廠家及型号:

Tecan M200pro 

功能應用(yòng)介紹:

光(guāng)栅波長(cháng)範圍涵蓋紫外到近紅外區(qū),用(yòng)于DNA/RNA定量檢測和(hé)蛋白定量檢測等。光(guāng)吸收波長(cháng)準确性: < ± 0.5 nm(波長(cháng) 315 nm以上); < ± 0.3 nm(波長(cháng) 315 nm以下(xià))波長(cháng)重複性: < ± 0,5 nm (波長(cháng) 315 nm以上); < ± 0.3 nm (波長(cháng) 315 nm以下(xià))熒光(guāng)波長(cháng)準确性: < ± 2 nm for λ > 315 nm; < ± 1 nm for λ ≤ 315 nm波長(cháng)重複性: < ± 1 nm for λ > 315 nm; < ± 0.5 nm for λ ≤ 315 nm 熒光(guāng)模式:頂部、底部檢測,濾光(guāng)系統。可(kě)以進行光(guāng)吸收、熒光(guāng)激發光(guāng)和(hé)發射光(guāng)全波段掃描檢測。

管理(lǐ)規則:

1、檢測需自備耗材。2、若因人(rén)爲導緻儀器損傷,研究組需承擔相應的(de)賠償責任。

按時(shí)計費:

開機費0 元;測樣按小時(shí)收取機時(shí)費

儀器管理(lǐ)員(yuán):邵文(37792288-930) 

(八) 激光(guāng)粒度儀

暫無圖片

生産廠家及型号:

英國馬爾文儀器有限公司 Marlvern Mastersizer 2000F

功能應用(yòng)介紹:

利用(yòng)先進的(de)激光(guāng)衍射技術與高(gāo)度實用(yòng)的(de)常規顆粒表征方法,采用(yòng)全自動化(huà)操作,測量粉末、懸浮物(wù)質和(hé)乳狀液等的(de)粒度及其分(fēn)布規律,并根據标準化(huà)程序得(de)出可(kě)靠的(de)測量結果。可(kě)用(yòng)于測定土壤樣品、沉積物(wù)的(de)粒度及其分(fēn)布規律,測定固體顆粒材料的(de)粒度,測定水(shuǐ)體中懸浮物(wù)的(de)粒度,測定乳液的(de)粒度及分(fēn)布規律等。

 

四、 植物(wù)觀察及前處理(lǐ)等

主要儀器介紹如下(xià):

(一) 台式冷(lěng)凍幹燥機

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生産廠家及型号:

Labconco FreeZone 6 L-84

功能應用(yòng)介紹:

該儀器複疊式雙1/3HP無氟制冷(lěng)系統可(kě)将冷(lěng)阱内溫度降到-84°C,集冰量6L,用(yòng)于水(shuǐ)溶性樣品或含乙腈的(de)樣品。用(yòng)于對(duì)中等量植物(wù)葉片、花、種子等材料樣品進行批量冷(lěng)凍幹燥,可(kě)以中到大(dà)量樣品或多(duō)批次樣品處理(lǐ)。

主要配置:

1、主機、帶加熱(rè)樣品架;

2、真空泵;

管理(lǐ)規則:

1、培訓後自行使用(yòng)。2、若因人(rén)爲導緻儀器損傷,研究組需承擔相應的(de)賠償責任。

按時(shí)計費:

開機費0 元;使用(yòng)按小時(shí)收取機時(shí)費

儀器管理(lǐ)員(yuán):沈雯(37792288-930) 

(二) 掃描電鏡

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生産廠家及型号:

SEM- FEI QUANTA250

功能應用(yòng)介紹:

二次電子像分(fēn)辨率:高(gāo)真空模式:≤3.0nm(30kV),背散射電子像分(fēn)辨率: 4.0 nm;加速電壓:0.2~30 kV用(yòng)于植物(wù)類掃描植物(wù)花粉、葉表皮、附屬物(wù)、腺體、維管束、花原基、胚胎等組織材料。處理(lǐ)樣品中不得(de)具有磁性,并且不易被磁化(huà),不得(de)含有油類和(hé)液體,樣品高(gāo)度小于30mm,直徑小于30mm,放大(dà)倍數40-20000倍。

主要配置:

1、掃描電鏡;

2、噴金儀(LEICA EM ACE200),噴金儀用(yòng)于掃描電鏡樣品的(de)前處理(lǐ),鉑/黃(huáng)金10nm/60sec;

按量計費:

開機費200 元;使用(yòng)按樣品數量收取費用(yòng)

儀器管理(lǐ)員(yuán):邵文(37792288-930) 

(三) 激光(guāng)共聚焦顯微鏡

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生産廠家及型号:

Olympus Fvi10

功能應用(yòng)介紹:

4根激光(guāng)器(405nm,473nm,559nm和(hé)635nm),各激光(guāng)器單獨分(fēn)立,整合輸出。物(wù)鏡放大(dà)倍數10-60倍,電動控制轉換。Z軸調焦驅動裝置,最小步進≤15nm。點掃描,矩形掃描,ZOOM IN 掃描,成像。用(yòng)于形态學、細胞生物(wù)學、分(fēn)子細胞生物(wù)學、神經科學、藥理(lǐ)學等研究領域,優先用(yòng)于動、植物(wù)細胞、組織水(shuǐ)平四通(tōng)道波長(cháng)信号檢測。

按量計費:

開機費200 元;使用(yòng)按樣品數量收取費用(yòng)

儀器管理(lǐ)員(yuán):邵文(37792288-930) 

(四) 熒光(guāng)顯微鏡

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生産廠家及型号:

Leica DM6000B

功能應用(yòng)介紹:

透射光(guāng)軸:12V100W鹵素燈;自動聚光(guāng)鏡頭;自動光(guāng)強管理(lǐ),BF、Cy3、JFP、YFP和(hé)Cy5濾鏡。用(yòng)于動、植物(wù)細胞、組織水(shuǐ)平五種濾鏡下(xià)信号檢測。

按量計費:

開機費100 元;使用(yòng)按樣品數量收取費用(yòng)

儀器管理(lǐ)員(yuán):邵文(37792288-930) 

(五) X-微焦射線儀

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生産廠家及型号:

UltraFocus60

功能應用(yòng)介紹:

探測器的(de)尺寸爲10x15cm,能量範圍從10到60KV,UltraFocus60成像樣本爲8μm的(de)焦點和(hé)6倍的(de)幾何放大(dà)倍數。用(yòng)于種子、花等動植物(wù)(含活體)器官的(de)成像

按量計費:

開機費50 元;使用(yòng)按樣品數量收取費用(yòng)

儀器管理(lǐ)員(yuán):邵文(37792288-930) 

(六) 超薄切片機

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生産廠家及型号:

Leica UC7

功能應用(yòng)介紹:

觸屏控制器顯示操作提示,多(duō)方位LED 照(zhào)明(míng),體視鏡方便對(duì)玻璃刀(dāo)/鑽石刀(dāo),常溫切片,全馬達操控刀(dāo)台,東、西方向可(kě)測量。用(yòng)于半薄和(hé)超薄切片高(gāo)精度切片厚度50nm~1um

按量計費:

使用(yòng)按樣品數量收取費用(yòng)

儀器管理(lǐ)員(yuán):邵文(37792288-930) 

(七) 切片機

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生産廠家及型号:

LEICA2245

功能應用(yòng)介紹:

獨立控制面闆的(de)半自動輪轉式切片機,2-20um軟石蠟樣品以及較硬樣品的(de)手動切片。用(yòng)于常規植物(wù)組織切片,花粉管,果實,胚胎,根莖葉等顯微切片。

儀器管理(lǐ)員(yuán):邵文(37792288-930) 

(八) 光(guāng)合分(fēn)析儀

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生産廠家及型号:

Li-Cor6400

功能應用(yòng)介紹:

主機、檢測器、紅藍光(guāng)源.用(yòng)于植物(wù)淨光(guāng)合速率(Pn)、氣孔導度(Gs)、蒸騰速率(E)、胞間CO2濃度(Ci)、大(dà)氣CO2濃度(Ca)等光(guāng)合和(hé)呼吸速率等生理(lǐ)指标。

儀器管理(lǐ)員(yuán):邵文(37792288-930) 

(九) 葉綠素熒光(guāng)儀

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生産廠家及型号:

 

功能應用(yòng)介紹:

主機、檢測手柄。用(yòng)于對(duì)植物(wù)進行葉綠素熒光(guāng)檢測,如葉綠素a、b等。

儀器管理(lǐ)員(yuán):邵文(37792288-930) 

(十) 制備型高(gāo)速離心機

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生産廠家及型号:

Beckman Coulter Avanti J-301

功能應用(yòng)介紹:

轉速100-26000 RPM最大(dà)相對(duì)離心力82000 最大(dà)容量 6L制冷(lěng)系統,溫度控制範圍 0~40℃。時(shí)間設定1分(fēn)鐘(zhōng)至99小時(shí),連續運行區(qū)帶離心功能,配有多(duō)種轉頭自動識别樣品量範圍1.5-1000ml。用(yòng)于動植物(wù)樣本低溫或常溫離心,可(kě)分(fēn)離純化(huà)各種細胞和(hé)細胞器,分(fēn)離病毒和(hé)生物(wù)大(dà)分(fēn)子,包括 DNA、RNA、蛋白質及脂類等。

儀器管理(lǐ)員(yuán):邵文(37792288-930)