2016年5月(yuè)24日下(xià)午,中國科學院馬普學會計算(suàn)生物(wù)學夥伴研究所李海鵬研究員(yuán)應邀訪問上海辰山植物園(中國科學院上海辰山植物(wù)科學研究中心),在科研中心會議(yì)室做(zuò)了(le)題爲“新近發生的(de)正選擇?還(hái)是假陽性?”的(de)學術報告,報告由觀賞植物(wù)組組長(cháng)田代科研究員(yuán)主持。
報告中,李老師系統介紹了(le)如何利用(yòng)科學的(de)方法準确檢測到近期發生的(de)正選擇,是将針對(duì)基因型的(de)研究上升到針對(duì)表型研究的(de)關鍵。重點講述了(le)利用(yòng)全基因組數據先估計群體進化(huà)曆史然後再檢測正選擇的(de)新方法,并與參會人(rén)員(yuán)就相關問題進行了(le)熱(rè)烈討(tǎo)論。據李老師介紹,這(zhè)種新的(de)方法提出從系統發育樹角度檢測正選擇,第一次在數學上證明(míng)該檢驗方法不受群體曆史的(de)幹擾,開創了(le)新的(de)基于系統發育樹檢測正選擇的(de)理(lǐ)論體系。提出新的(de)颠覆性的(de)高(gāo)效算(suàn)法估算(suàn)遺傳重組率,比使用(yòng)最爲普遍的(de)LDhat快(kuài)10萬倍以上,但估值卻和(hé)後者一樣精确,從而避免檢測正選擇時(shí)候的(de)遺傳重組率的(de)幹擾,已經成爲一個(gè)在國際上被普遍采用(yòng)的(de)分(fēn)析策略。
本次講座爲辰山科研中心開展相關研究提供了(le)新的(de)思路和(hé)方法,爲進一步開展雙方合作研究創造了(le)條件。