上海市資源植物(wù)功能基因組學實驗室

科學研究

聯系我們

中國上海市松江區(qū)辰花路3888号
上海辰山植物(wù)科學研究中心
郵編 201632

電話(huà)（021）37792288

傳真（021）67657811

蕨類分(fēn)子生态與功能演化(huà)研究組

課題組長(cháng)

研究組長(cháng)：沈慧，博士，副研究員(yuán)

通(tōng)訊地址：上海市松江區(qū)辰花路3888号，中國科學院上海辰山植物(wù)科學研究中心（201602）

電　　話(huà)：021-37792288-908

郵　　箱：shenhui@cemps.ac.cn

　　沈慧，2004年畢業于東北(běi)農業大(dà)學生命科學學院，獲理(lǐ)學學士學位；2004至2011年就讀于中科院上海植物(wù)生理(lǐ)生态研究所分(fēn)子遺傳學專業，獲得(de)理(lǐ)學博士學位；2011年9月(yuè)-2013年9月(yuè)在中科院植生所分(fēn)子遺傳國家重點實驗室進行博士後研究。2013年至2020年先後在上海辰山植物園/中國科學院上海辰山植物(wù)科學研究中心蕨類多(duō)樣性與進化(huà)研究組擔任助理(lǐ)研究員(yuán)、副研究員(yuán)。2020年至今任中科院分(fēn)子植物(wù)科學卓越創新中心副研究員(yuán)，中科院上海辰山植物(wù)科學研究中心蕨類分(fēn)子生态與功能演化(huà)課題組青年PI。任中國野生植物(wù)保護協會蕨類植物(wù)專業委員(yuán)會理(lǐ)事。主要從事植物(wù)與環境互作、蕨類植物(wù)分(fēn)子進化(huà)生物(wù)學等方面的(de)研究。先後在Nature Biotechnology、 GigaScience等刊物(wù)發表論文多(duō)篇。

研究領域

　　在蕨類植物(wù)資源收集與保育的(de)基礎上，利用(yòng)組學及分(fēn)子生物(wù)學研究手段，開展蕨類植物(wù)系統演化(huà)、适應性形成、與昆蟲互作等方面的(de)研究。

研究内容

　　1）蕨類植物(wù)系統分(fēn)類與進化(huà)

　　2）水(shuǐ)蕨屬植物(wù)系統發育和(hé)功能基因組

　　3）蕨類植物(wù)與昆蟲互作的(de)分(fēn)子機制及代謝基礎

科研成果

學術論文

　　1 Yunong Mu, YuehongYan, Baodong Liu, Hui Shang*. The complete chloroplast genome sequence of Hypolepis sparsisora (Dennstaedtiaceae). Mitochondrial DNA. Part B, Resources, 2020, 5(1)

　　2 Hui Shang, Xue Zhiqing, Gu Yingfeng & Zhang Lingbing*. Revision of the fern genus Didymochlaena (Didymochlaenaceae) from Madagascar. Phytotaxa, 2020, 459(4): 252–264

　　3 Rui Zhang, Jun-Hao Yu, Wen Shao, Wei-Qing Wang, Hui Shang, Xi-Long Zheng, Yue-Hong Yan*. Ceratopteris shingii, a new species of Ceratopteris with creeping rhizomes from Hainan, China. Phytotaxa, 2020, 449 (1): 023–030

　　4 Rui Zhang#, Fa-Guo Wang#, Jiao Zhang, Hui Shang, Li Liu, Hao Wang, Guo-Hua Zhao, Hui Shen, Yue-Hong Yan*. Dating whole genome duplication in Ceratopteris thalictroides and potential adaptive values of retained gene duplicates. International Journal of Molecular Sciences, 2019, 20:1926

　　5 Jiao Zhang, Li Liu, Jiang-Ping Shu, Dong-Mei Jin, Hui Shen, Hong-Feng Chen, Rui Zhang*, Yue-Hong Yan*. Transcriptomic evidence of adaptive evolution of the epiphytic fern Asplenium nidus Adaptive evolution of Asplenium nidus. International Journal of Genomics, 2019, 1429316

　　6 汪浩#, 張銳#, 張嬌, 沈慧, 戴錫玲, 嚴嶽鴻*. 轉錄組揭示翼蓋蕨多(duō)倍化(huà)曆史. 生物(wù)多(duō)樣性, 2019, 27(11):1221-1227

　　7 Hui Shen#, Dongmei Jin#, Jiang-Ping Shu, Xi-Le Zhou, Ming Lei, Ran Wei, Hui Shang, Hong-Jin Wei, Rui Zhang, Li Liu, Yu-Feng Gu, Xian-Chun Zhang and Yue-Hong Yan*. Large scale phylogenomic analysis resolves a backbone phylogeny in ferns. GigaScience, 2018, 7 (2): 1-11

　　8 Junjie Luo, Morigengaowa, Hongjin Wei et al. & Hui Shang*. Stegnogramma leptogrammoides (Thelypteridaceae), its discovery in China, and synonymy. Phytotaxa, 2018, 376(2): 81-88

　　9 Morigengaowa, Junjie Luo, Ralf Knapp, et al. & Hui Shang*. The identity of Hypolepis robusta, as a new synonym of Hypolepis alpina (Dennstaedtiaceae), based on morphology and DNA barcoding and the new distribution. PhytoKeys, 2018, (96): 35

　　10 Hui Shang, Michael Sundue, Wei Ran, et al. Hiya: A new genus segregated from Hypolepis in the fern family Dennstaedtiaceae based on phylogenetic evidence and character evolution. Molecular phylogenetics and evolution, 2018, 127: 449-458

　　11 劉莉，舒江平，韋宏金，張銳，沈慧*，嚴嶽鴻，東亞特有珍稀蕨類植物(wù)岩穴蕨（碗蕨科）高(gāo)通(tōng)量轉錄組測序及分(fēn)析，生物(wù)多(duō)樣性，2016，24（12）：1325~1334

　　12 朱曉鳳，沈慧*，金冬梅，趙國華，劉保東，淩鐵軍，嚴嶽鴻，四種蕨類植物(wù)的(de)孢子繁殖研究，植物(wù)研究，2016，36（2）：167~176

　　13 Hui Shen#, Xiangbin Zhong#, Fangfang Zhao, Yanmei Wang, Bingxiao Yan, Qun Li, Genyun Chen, Bizeng Mao, Jianjun Wang, Yangsheng Li, Guoying Xiao, Yuke He, Han Xiao, Jianming Li, Zuhua He*, Overexpression of Receptor-like Kinase ERECTA Improves Thermotolerance in Rice and Tomato, Nature Biotechnology, 2015, 33(9): 996-100

　　14 Ran Wei, Yue-Hong Yan, AJ Harris, Jong-Soo Kang, Hui Shen, Qiao-Ping Xiang and Xian-Chun Zhang*. 2017. Plastid phylogenomics resolve deep relationships among eupolypod II ferns with rapid radiation and rate heterogeneity. Genome Biology Evolotion, 2017, 9 (6): 1646–1657

　　15 Jiang-Ping Shu, Hui Shang, Dong-Mei Jin, Hong-Jin Wei, Xi-Le Zhou, Hong-Mei Liu, Yu-Feng Gu, Ying Wang, Fa-Guo Wang, Hui Shen, Rui Zhang, Bayu Adjie and Yue-Hong Yan*, Re-establishes species from Synonymies Based on DNA Barcoding and Phylogenyanalysis: Using Diplopterygium simulans (Gleicheniaceae) As an Example, PLos One, 2017, 12 (3): e0164604

　　16 舒江平，劉莉，沈慧，戴錫玲，王全喜，嚴嶽鴻*，基于系統基因組學分(fēn)析揭示早期陸生植物(wù)的(de)複雜(zá)網狀進化(huà)關系，生物(wù)多(duō)樣性，2017, 25 (6): 675-682

　　17 黃(huáng)科瑞, 商輝，嚴嶽鴻等. 齒緣刺獵蝽生活史及其生物(wù)學特性. 環境昆蟲學報, 2017, 39(6), 1350-1355

　　18 商輝 & 嚴嶽鴻*. 昆蟲幼蟲對(duì)鳳尾蕨屬植物(wù)孢子囊群的(de)拟态. 自然雜(zá)志, 2014, 36(6): 426-430

專著

　　嚴嶽鴻，陳彬，秦新生，商輝，衛然，王發國，韋宏金，齊新萍，沈慧，李中陽，張良，張榮京，張憲春，張銳，陳紅鋒，陳沂章(zhāng)，羅文啓，金冬梅，鄭希龍，顧钰鋒，黃(huáng)向旭，黃(huáng)科瑞，舒江平，黎昌漢，海南(nán)蕨類植物(wù)，中國林(lín)業出版社，ISBN 978-7-5038-9720-7，612千字，2018

研究組成員(yuán)

研究助理(lǐ)（以姓氏拼音(yīn)爲序）