研究隊伍

茄科進化(huà)與代謝研究組

> 課題組長(cháng)

　　研究組長(cháng)：陳可(kě)，博士，青年研究員(yuán)

　　通(tōng)訊地址：上海市松江區(qū)辰花路3888号，中國科學院上海辰山植物(wù)科學研究中心（201602）

　　電話(huà)：021-37792288-907

　　郵箱：chenke@csnbgsh.cn

　　陳可(kě)，2016年3月(yuè)獲得(de)細胞與分(fēn)子生物(wù)學博士學位（法國國家科學院植物(wù)細胞分(fēn)子生物(wù)學研究所，斯特拉斯堡大(dà)學，法國；Institut de biologie moléculaire des plantes , Centre National de la Recherche Scientifique, Université de Strasbourg，France ）。2016年至2021年在上海交通(tōng)大(dà)學系統生物(wù)醫學研究院任助理(lǐ)研究員(yuán)。2021年6月(yuè)加入上海辰山植物園（中國科學院上海辰山植物(wù)科學研究中心），任茄科進化(huà)與代謝組青年課題組長(cháng)（Junior PI）。主持國家自然科學基金，上海市綠容綠化(huà)管理(lǐ)局專項基金，上海市“揚帆計劃”人(rén)才計劃，上海市“青年英才”計劃，上海交大(dà)醫工交叉基金等。研究方向爲茄科功能基因研究，比較基因組學，代謝組學等。

> 研究領域

　　茄科植物(wù)功能基因解析，生長(cháng)狀态研究，代謝組學，單細胞組學等多(duō)組學數據信息深度挖掘及細胞工程研究

>研究内容

　　1）可(kě)塑性基因家族對(duì)茄科植物(wù)生長(cháng)性狀調控

　　2）茄科植物(wù)cT-DNA序列及功能研究

　　3）植物(wù)生物(wù)工程技術及功能基因相關的(de)小分(fēn)子代謝調控

> 科研成果

學術論文

　　1. Ke Chen#, Peter Zhurbenko#, Lavrentii Danilov, Tatiana Matveeva and Léon Otten*. Conservation of an Agrobacterium cT-DNA Insert in Camellia Section Thea Reveals the Ancient Origin of Tea Plants from a Genetically Modified Ancestor, Frontiers in Plant Science, 2022, 6;13:997762.

　　2. Jiawei Zou, Fulan Deng, Miaochen Wang, Zhen Zhang, Zheqi Liu, Xiaobin Zhang, Rong Hua, Ke Chen*, Xin Zou*, Jie Hao*, scCODE:an R package for data-specific differentially expressed gene detection on single-cell RNA-sequencing data, Brief Bioinform, 2022, 23;bbac180.

　　3. Léon Otten, T‑DNA regions from 350 Agrobacterium genomes: maps and phylogeny, Plant Molecular Biology, 2021, 106:239–258.

　　4. Tatiana V Matveeva, Léon Otten*. Opine biosynthesis in naturally transgenic plants: Genes and products." Phytochemistry, 2021, 189: 112813.

　　5. Xin Zou#, Ke Chen#, Jiawei Zou, Peiyi Han, Jie Hao, Zeguang Han, The single-cell RNA-seq data analysis on the receptor ACE2 expression reveals the potential risk of different human organs vulnerable to Wuhan 2019-nCoV infection, Frontiers of medicine, 2020, 14(2):185-192.

　　6. Thomas Potuschak, Javier Palatnik, Carla Schommer, Nicolas Sierro, Nikolai V Ivanov, Yerim Kwon, Pascal Genschik, Jean-Michel Davière, Léon Otten*, Inhibition of Arabidopsis thaliana CIN-like TCP transcription factors by Agrobacterium T-DNA-encoded 6B proteins, Plant Journal, 2020, 101(6):1303-1317.

　　7. Tatiana V Matveeva, Léon Otten*, Widespread occurrence of natural genetic transformation of plants by Agrobacterium, Plant Mol Biol, 2019,101(4-5):415-437.

　　8. Léon Otten*, The Agrobacterium Phenotypic Plasticity (Plast) Genes, Curr Top Microbiol Immunol, 2018, 418:375-419.

　　9. Ke Chen, François Dorlhac de Borne, Nicolas Sierro, Nikolai V. Ivanov, Malek Alouia, Sandrine Koechler, Léon Otten*, Organization of the TC and TE cT-DNA regions in Nicotiana otophora and functional analysis of three diverged TE-6b genes, Plant Journal, 2018, 94(2):274-287.

發明(míng)專利

　　1. 一種植物(wù)生長(cháng)基因與發育階段和(hé)細胞類型關系判定方法。202211166112.5。

　　2. 一種植物(wù)生長(cháng)發育動态監控的(de)方法。202211200145.7。

　　3. 抑制新型冠狀病毒SARS-CoV-2感染宿主細胞的(de)多(duō)肽及其應用(yòng)。CN202010450107.1。

　　4. 一種基于核磁共振譜洛倫茲曲線數學性質的(de)小波去噪方法。CN201810953635.1。

　　5. 一種獨立計算(suàn)具有90度相位差的(de)洛倫茲曲線參數的(de)方法。CN201810906851.0。

> 研究組成員(yuán)

>科學顧問