上海辰山植物園 English
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>課題組長(cháng)
 | 課題組長(cháng)：趙清，博士，研究員(yuán) 通(tōng)訊地址：上海市松江區(qū)辰花路3888号，上海辰山植物園科研中心 （201602） 聯系電話(huà)：021-37792288 |
趙清，2013年6月(yuè)獲博士學位（天津大(dà)學及英國John Innes Centre聯合培養）。從2013年6月(yuè)到2018年2月(yuè)，先後在John Innes Centre，中國科學院上海生命科學研究院從事博士後研究。2018年2月(yuè)到上海辰山植物園(中國科學院分(fēn)子植物(wù)科學卓越創新中心辰山科學研究中心)工作，先後任科研助理(lǐ)，青年課題組長(cháng)（Junior PI），課題組長(cháng)（PI）。曾獲中國植生協會青年優秀論文獎，“賽諾菲—中科院上海生命科學研究院（SANOFI-SIBS）優秀青年學者獎；入選上海市青年拔尖人(rén)才（2020年），中科院青促會會員(yuán)（2019年），中國植生學會代謝專委會委員(yuán)（2019年）。研究方向集中于黃(huáng)芩屬及相關物(wù)種比較基因組學，藥用(yòng)成分(fēn)代謝途徑解析，調控機制及這(zhè)些代謝物(wù)在相關物(wù)種中的(de)進化(huà)機制，也(yě)涉及活性分(fēn)子促進健康機制的(de)研究。
>研究領域
黃(huáng)芩屬（及相關物(wù)種）植物(wù)代謝生物(wù)學 ，目前開展的(de)方向有：
1、黃(huáng)芩屬植物(wù)基因組及代謝組學；
2、黃(huáng)芩中黃(huáng)酮成分(fēn)的(de)合成途徑解析及調控機制研究；
3、植物(wù)生物(wù)技術及植物(wù)底盤的(de)合成生物(wù)學
> 科研項目
1. 上海市綠化(huà)和(hé)市容管理(lǐ)局辰山專項；黃(huáng)芩屬植物(wù)類黃(huáng)酮代謝産物(wù)分(fēn)析及代謝途徑解析（G172402），2017.01-2019.12；
2. 上海市綠化(huà)和(hé)市容管理(lǐ)局辰山專項；藥用(yòng)植物(wù)黃(huáng)芩中重要黃(huáng)酮合成轉錄調控機制的(de)研究（G182401），2018.01-2020.12；
3. 自然科學基金青年項目：黃(huáng)芩中黃(huáng)芩素、漢黃(huáng)芩素合成途徑中黃(huáng)酮羟化(huà)酶的(de)研究，31700268，2018年1月(yuè)-2020年12月(yuè)；
4. 自然科學基金面上項目：黃(huáng)芩中甲氧基黃(huáng)酮合成途徑中氧位甲基轉移酶基因家族的(de)研究，3187011384，2019年1月(yuè)-2022年12月(yuè)；
5. 科技部國家重點研發計劃課題：常用(yòng)中藥活性成分(fēn)的(de)合成生物(wù)學研究-黃(huáng)芩素等黃(huáng)酮的(de)合成生物(wù)學制備體系研建，2018YFC1706202，2019 年1月(yuè)-2021 年 12 月(yuè)；
6. 中科院青年創新促進會項目：2019年1月(yuè)-2022年12月(yuè)；
7. 上海市青年拔尖人(rén)才項目：2020年1月(yuè)-2022年12月(yuè)；
8. 上海市自然科學基金原創探索項目：2022年4月(yuè)-2025年4月(yuè)。
> 重要成果
代表論文（#第一作者*通(tōng)訊作者）
科研論文
1. Liu, J*. Zhao Y.-X*. et al. Zhao, Q#. (2024) Production of species-specific anthocyanins through an inducible system in plant hairy roots. Metabolic Engineering. 81: 182-196.
2. Pei, T.-L, Zhu, S.-M. et al Cui, M.-Y#, Zhao, Q#. (2023) Gap-free genome assembly and CYP450 gene family analysis reveal the biosynthesis of anthocyanins in Scutellaria baicalensis. Horticulture Research. 10(12): uhad235
3. Fang, Y.-M, et al Zhao, Q#. (2023) SbMYB3 transcription factor promotes root-specific flavone biosynthesis in Scutellaria baicalensis. Horticulture Research. 10(2): uhac266
4. Zheng, M, Fang, Y#, Zhao, Q#. (2023). Comparative analysis of flavones from six commonly used Scutellaria species. Medicinal Plant Biology 2:12
5. Cui, M.-Y, Lu, A.-R, Li, J.-X, Liu, J, Fang, Y.-M, Pei, T.-L, Zhong, X, Wei, Y.-K, Kong, Y, Qiu, W.-Q, Hu, Y.-H, Yang, J, Chen, X.-Y, Martin, C and Zhao, Q#. (2022) Two types of O-methyltransferase are involved in biosynthesis of anticancer methoxylated 4′-deoxyflavones in Scutellaria baicalensis Georgi. Plant Biotechnology Journal. 20: 129-142.
6. Qian et al. Zhao Q#, Cai M-H#. (2022). De novo production of plant 4′-deoxyflavones baicalein and oroxylin A from ethanol in crabtree-negative yeast. ACS Synthetic Biology. 11 (4): 1600-1612.
7. Pei, T.-L, et al Zhao, Q#. (2022) Characterization of UDP-glycosyltransferase family members reveals how major flavonoid glycoside accumulates in the roots of Scutellaria baicalensis. BMC Genomics 23: 169.
8. Zhao, Q*. Yang, J* Cui M-Y et al. Martin, C# (2019). The reference genome sequence of Scutellaria baicalensis reveals how wogonin biosynthesis evolved. Molecular Plant. 12 (7): 935-950.
9. Zhao, Q*. Cui, M-Y*. Levsh, O. Yang D-F. Liu, J. Li, J. Hill, L. Yang, L. Hu, Y. Weng, J-K. Chen, X-Y. Martin, C# (2018) Two CYP82D enzymes function as flavone hydroxylases in the biosynthesis of root-specific 4′-deoxyflavones in Scutellaria baicelensis. Molecular Plant. 11(1): 135-148.
10. Zhao Q, Zhang Y, Wang G, Hill L, Weng J-K, Chen X-Y, Xue H, Martin C# (2016) A specialized flavone biosynthetic pathway has evolved in the medicinal plant, Scutellariabaicalensis. Science Advances. 2, e1501780.
綜述
1. Pei, T.-L, et al Zhao, Q#. (2022) Specific Flavonoids and Their Biosynthetic Pathway in Scutellaria baicalensis. Frontiers in Plant Science. 13:866282.
2. 鄭敏敏、柳潔、趙清 (2023)；藥用(yòng)植物(wù)黃(huáng)芩的(de)生物(wù)學研究進展及展望 ，生物(wù)技術通(tōng)訊 （特邀綜述）39(2): 10-23
3. 方譽民，崔孟穎，柳潔，裴天林(lín)，魏宇昆，趙清*. 黃(huáng)芩屬植物(wù)黃(huáng)酮生物(wù)合成研究進展. 中國中藥雜(zá)志, 2020, 45(20): 4819-4826.
4. Zhao Q, Chen X-Y# (2016) Development: A new function of plant trichomes. Nature Plants. 2(7).
5. 崔孟穎,柳潔,楊蕾,Cathie Martin,陳曉亞,趙清#. 黃(huáng)芩,由古籍裏走進現代生活的(de)藥用(yòng)植物(wù)；世界科學技術-中醫藥現代化(huà)18（11）1921-1928.
6. Zhao Q, Chen X-Y, Martin C# (2016). Scutellaria baicalensis, the golden herb from the garden of Chinese medicinal plants. Science Bulletin. 61(18):1391–1398
專利
1. 一種與黃(huáng)芩中黃(huáng)酮合成物(wù)相關的(de)基因序列及應用(yòng)，專利号201710444685.2；
2. 黃(huáng)芩中花青素轉錄調控因子SbMYB75和(hé)SBDEL的(de)基因克隆載體構建及其應用(yòng)，專利号201910330805.5；
3. 黃(huáng)芩黃(huáng)酮苯丙素和(hé)類黃(huáng)酮O-甲基轉移酶基因及其載體構建和(hé)應用(yòng)，專利号：201910330809.3；
> 研究組成員(yuán)
 | 科學顧問：Cathie Martin，博士，研究員(yuán)，教授，英國皇家學會會員(yuán)（FRS） |
Cathie Martin，英國John Innes Centre研究員(yuán)，從2016年4月(yuè)開始，在上海辰山植物(wù)研究中心兼職。迄今爲止，共有7個(gè)專利，發表了(le)200餘篇SCI期刊論文，參與編寫40本書(shū)和(hé)會議(yì)論文集，所發表的(de)作品共有近兩萬次引用(yòng)。緻力于植物(wù)細胞分(fēn)化(huà)及植物(wù)次生代謝生物(wù)學領域的(de)研究，并且首次發現調控細胞外形的(de)基因，研究興趣涵蓋了(le)整個(gè)植物(wù)生物(wù)學，包括從植物(wù)基礎研究到技術的(de)應用(yòng)。
> 研究助理(lǐ)（以姓氏拼音(yīn)爲序）
 | 崔孟穎 科研助理(lǐ) 電話(huà)：021-37792288 |  | 柳潔 科研助理(lǐ) 電話(huà)：021-37792288 |
 | 方譽民 科研助理(lǐ) 電話(huà)：021-37792288 郵箱：fangyumin2014@sina.com |  | 裴天林(lín) 博士 科研助理(lǐ) 電話(huà)：021-37792288 郵箱：tianlinpei@163.com |
