主要工作包括： 
1) 植物(wù)次生代謝研究 
植物(wù)萜類生物(wù)合成及調控：棉酚、青蒿素生物(wù)合成關鍵酶基因克隆與表達調控，代謝工程等； 
丹參等唇形科植物(wù)中的(de)苯丙烷類化(huà)合物(wù)代謝及調控； 
2)植物(wù)-昆蟲相互關系研究 
植物(wù)次生代謝與抗蟲，植物(wù)介導的(de)RNA幹擾抗蟲新技術； 
3) 棉纖維發育調控的(de)分(fēn)子機制研究 
棉纖維發育調控因子克隆與分(fēn)析，植物(wù)表皮毛發育調控機制。 
研究組網頁：http://sippe.ac.cn/xy/

國家“傑出青年基金”獲得(de)者 
“何良何利獎”獲得(de)者

指導研究生總數爲19人(rén)，目前在讀12人(rén)

1982年2月(yuè)畢業于南(nán)京大(dà)學生物(wù)系，獲學士學位 
1985年12月(yuè)獲英國Reading 大(dà)學植物(wù)學博士學位 
1985-1991年在南(nán)京大(dà)學生物(wù)系任教 
1991-1992年在德國Tuebingen大(dà)學植物(wù)學系進行訪問研究 
1992-1994年在美(měi)國Purdue大(dà)學做(zuò)博士後研究 
1994年10月(yuè)至今在中國科學院上海生命科學研究院植物(wù)生理(lǐ)生态研究所（原中科院上海植物(wù)生理(lǐ)研究所）工作 
現任植物(wù)生理(lǐ)生态研究所研究員(yuán)，上海辰山植物(wù)科學研究中心主任。 
已在國内外發表論文60餘篇（包括Nature Biotechnology, Nature Communications, Plant Cell, Plant Physiology等國際重要刊物(wù)），申請專利數項。主持國家重點基礎研究發展計劃（973）課題、中科院重要方向性項目，國家自然科學基金重點項目等。1999年獲國家傑出青年基金資助，2005年入選中國科學院院士，2008年入選發展中國家科學院院士。

1.     Yu ZX, Wang LJ, Zhao B, Shan CM, Zhang YH, Chen DF, Chen XY*. 2014. Progressive Regulation of Sesquiterpene Biosynthesis in Arabidopsis and Patchouli (Pogostemon cablin) by the miR156-Targeted SPL Transcription Factors. Mol. Plant 8(1): 98-110.
2.     Shan CM, Shangguan XX, Zhao B, Zhang XF, Chao LM, Yang CQ, Wang LJ, Zhu HY, Zeng YD, Guo WZ, Zhou BL, Hu GJ, Guan XY, Chen JZ, Wendel JF, Zhang TZ, Chen XY*. 2014. Control of cotton fibre elongation by a homeodomain transcription factor GhHOX3. Nat. Commun. 5:5519 doi: 10.1038/ncomms6519 (2014). 
3.     Xue XY, Zhao B, Chao LM, Chen DY , Cui WR , Mao YB, Wang LJ, Chen XY. 2014. Interaction between Two Timing MicroRNAs Controls Trichome Distribution in Arabidopsis. PLOS Genetics. doi: 10.1371/journal.pgen.1004266
4.     Yang L, Ding GHi, Lin HY, Cheng HN, Kong Y, Wei YK, Fang X, Liu RY, Wang LJ, Chen XY and Yang CQ. 2013. Transcriptome analysis of medicinal plant Salvia miltiorrhiza and identification of genes related to tanshinone biosynthesis. PLOS ONE. 8(11):e80464.
5.     Mao YB, Xue XY, Tao XY, Yang CQ, Wang LJ, Chen XY*. 2013. Cysteine protease enhances plant-mediated bollworm RNA interference. Plant Mol Biol. 83(1-2): 119-29. 
6.     Li JX, Fang X, Zhao Q, Ruan JX, Yang CQ, Wang LJ, Miller DJ, Faraldos JA, Allemann RK, Chen XY*, Zhang P*. 2013. Rational engineering plasticity residues of sesquiterpene synthases from Artemisia annua: product specificity and catalytic efficiency. Biochemical Journal 451(3):417-426. 
7.     Xu B, Gou JY, Li FG, Shangguan XX, Zhao B, Yang CQ, Wang LJ, Yuan S, Liu CJ, Chen XY*. 2013. A Cotton BURP Domain Protein Interacts With α-Expansin and Their Co-Expression Promotes Plant Growth and Fruit Production. Mol. Plant 6 (3): 945-958.
8.     Hong GJ, Xue XY, Mao YB, Wang LJ, Chen XY*. 2012. Arabidopsis MYC2 Interacts with DELLA Proteins in Regulating Sesquiterpene Synthase Gene Expression. Plant Cell 24: 2635–2648.
9.     Tao XY, Xue XY, Huang YP, Chen XY and Mao YB*. 2012. Gossypol-enhanced P450 gene pool contributes to cotton bollworm tolerance to a pyrethroid insecticide. Molecular Ecology 21, 4371–4385.
10.   Yu ZX, Li JX, Yang CQ, Hu WL, Wang LJ, and Chen XY*. 2012. The Jasmonate-Responsive AP2/ERF Transcription Factors AaERF1 and AaERF2 Positively Regulate Artemisinin Biosynthesis in Artemisia annua L. Mol. Plant 5(2): 353-365. 
11.   Zhang T et al. 2015. Sequencing of allotetraploid cotton (Gossypium hirsutum L. acc. TM-1) provides a resource for fiber improvement. Nature Biotechnology 33,531–537.